Nejstarší část města Brandýsa n. Orlicí se nazývá Loukoť (dnešní západní část) a je doložená již v r.1227. Po vystavění hradu se Loukoť stala součástí podhradí. Roku 1503 byl Brandýs povýšen na město. Panství patřilo několika panským rodům, z nichž významný byl kališnický rod Kostkové z Postupic, kdy se město stalo střediskem jednoty bratrské.
Tradice lázeňství v Brandýse započala v 19. století. V r.1898 zahájil provoz Vodoléčebný ústav, v r.1958 se změnil na Odbornou dětskou léčebnu ortopedických vad pro děti od 6 do 15 let. Od r. 1992 se naopak zaměřil na dospělé pacienty a jeho současný název je Rehabilitační ústav.
Brandýs n.Orlicí leží v chráněném území Přírodního parku Orlice. Je nejmenším městem Pardubického kraje.